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### This is the template for the first iteration of an OEM inversion
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### Spectroscopy: ############################################################
tgsDefine { 
   [$Q.RETRIEVAL_TAGS$,$Q.OTHER_TAGS$] 
}
wfs_tgsDefine { 
   [] 
}
lineshapeDefine { 
   shape               = "$Q.LINESHAPE$"
   normalizationfactor = "$Q.LINESHAPE_FACTOR$" 
   cutoff              =  $Q.LINESHAPE_CUTOFF$
} 
linesReadFromArts { 
   filename = "$Q.SPECTRO_DIR$/$Q.LINEFILE$"
   fmin     = 0
   fmax     = 10e18 
}
lines_per_tgCreateFromLines {
}  
#
§qpi_continua



### p_abs ####################################################################
VectorReadAscii( p_abs ) { 
   "$Q.CALCGRIDS_DIR$/$Q.P_ABS$" 
}


### Monochromatic frequency grid #############################################
VectorReadAscii( f_mono ) { 
   "$Q.CALCGRIDS_DIR$/$Q.F_MONO$" 
}


### The atmosphere ###########################################################
MatrixReadAscii ( raw_ptz_1d ) { 
   filename = "$Q.APRIORI_PTZ$" 
}
raw_vmrs_1dReadFromScenario {
   basename = "$Q.APRIORI_VMR_DIR$" 
}
AtmFromRaw1D {
   CloudSatWV = "no"           
}
h2o_absSet {
}
n2_absSet {
}


### The geoid ###############################################################
r_geoidStd {
}


### Hydrostatic eq. ###########################################################
IF Q.HSE_IN_ON
hseSet{
   pref  = $Q.HSE_PREF$
   zref  = $Q.HSE_ZREF$
   g0    = 9.81
   niter = 2 }
hseCalc{}
ELSE
hseOff{}
END


### The ground ###############################################################
groundSet{
   z = $Q.GROUND_ALTITUDE$
   e = $Q.GROUND_EMISSION$
}


### Absorption ################################################################
absCalc {
}
abs_per_tgReduce {
}


### Refraction ################################################################
IF Q.REFRACTION_ON
refrSet{
  on    = 1
  model = "$Q.REFR_METHOD$"
  lfac  = $Q.REFR_LFAC$
}
ELSE
refrOff{}
END
refrCalc{}


### Emission #################################################################
IntSet( emission ) {
   value = $Q.EMISSION_ON$
}


### Observation geometry ######################################################
NumericSet ( z_plat ) { 
   value = $Q.PLATFORM_ALTITUDE$
}
VectorReadAscii ( za_pencil ) { 
   "$Q.CALCGRIDS_DIR$/$Q.ZA_PENCIL$" 
}
NumericSet ( l_step ) { 
   value = $Q.STEPLENGTH_RTE$ 
}


### LOS and RTE ##############################################################
y_spaceStd { "cbgr" }
losCalc    {}
sourceCalc {}
transCalc  {}
yCalc      {}
VectorWriteBinary( y ) { "" }


IF Q.EMISSION_ON
### Convert to RJ temperatures. ##############################################
VectorCopy( f_sensor, f_mono ) { 
}
VectorCopy ( za_sensor, za_pencil ) { 
}
yTRJ {}
END


### Save #####################################################################
VectorWriteBinary( y ) { 
   ""
}
VectorWriteBinary( p_abs ) { 
   ""
}
VectorWriteBinary( t_abs ) { 
   ""
}
VectorWriteBinary( z_abs ) { 
   ""
}
ArrayOfVectorWriteBinary( vmrs ) { 
   ""
}