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### This is the template for iterations >= 2 of an OEM inversion, part 2
###

### Spectroscopy: ############################################################
IF isempty(Q.OTHER_TAGS)
tgsDefine { 
   [$Q.RETRIEVAL_TAGS$] 
}
END
IF isempty(Q.RETRIEVAL_TAGS)
tgsDefine { 
   [$Q.OTHER_TAGS$] 
}
END
IF ~isempty(Q.OTHER_TAGS) & ~isempty(Q.RETRIEVAL_TAGS)
tgsDefine { 
   [$Q.RETRIEVAL_TAGS$,$Q.OTHER_TAGS$] 
}
END
IF ~isempty(Q.RETRIEVAL_TAGS)
wfs_tgsDefine { 
   [$Q.RETRIEVAL_TAGS$] 
}
ELSE
wfs_tgsDefine { 
   [] 
}
END
lineshapeDefine { 
   shape               = "$Q.LINESHAPE$"
   normalizationfactor = "$Q.LINESHAPE_FACTOR$" 
   cutoff              =  $Q.LINESHAPE_CUTOFF$
} 
linesReadFrom$Q.LINEFORMAT$ { 
   filename = "$Q.SPECTRO_DIR$$Q.FILESEP$$Q.LINEFILE$"
   fmin     = 0
   fmax     = 10e18 
}
lines_per_tgCreateFromLines {
}  
#
@qpi_continua



### p_abs ####################################################################
VectorRead$QE.FORMAT$( p_abs ) { 
   "" 
}


### Monochromatic frequency grid #############################################
VectorRead$QE.FORMAT$ ( f_mono ) { 
   "" 
}


### The atmosphere ###########################################################
VectorRead$QE.FORMAT$( t_abs ) { 
   "" 
}
VectorRead$QE.FORMAT$( z_abs ) { 
   "" 
}
MatrixRead$QE.FORMAT$( vmrs ) { 
   "" 
}
h2o_absSet {
}
n2_absSet {
}


### Hydrostatic eq. ###########################################################
VectorRead$QE.FORMAT$( hse ) { "" }


### The ground ###############################################################
r_geoidStd {
}
NumericRead$QE.FORMAT$( z_ground ) { "" }
NumericRead$QE.FORMAT$( t_ground ) { "" }
VectorRead$QE.FORMAT$( e_ground ) { "" }


### Absorption ################################################################
MatrixRead$QE.FORMAT$( abs ) { "" }  
ArrayOfMatrixRead$QE.FORMAT$( abs_per_tg ) { "" }  


### Refraction ################################################################
IF Q.REFRACTION_ON
refrSet{
  on    = 1
  model = "$Q.REFR_METHOD$"
  lfac  = $Q.REFR_LFAC$
}
ELSE
refrOff{}
END
refrCalc{}



### Emission #################################################################
IndexSet( emission ) {
   value = $Q.EMISSION_ON$
}


### Observation geometry ######################################################
NumericSet ( z_plat ) { 
   value = $Q.PLATFORM_ALTITUDE$
}
VectorRead$QE.FORMAT$ ( za_pencil ) { 
   "" 
}
NumericSet ( l_step ) { 
   value = $Q.STEPLENGTH_RTE$ 
}



### LOS #######################################################################
losCalc    {}



### RTE variables #############################################################
VectorRead$QE.FORMAT$( y_space ) { "" }
#LosRead$QE.FORMAT$( los ){ "" }
ArrayOfMatrixRead$QE.FORMAT$( source ) { "" }  
ArrayOfMatrixRead$QE.FORMAT$( trans ) { "" }  
VectorRead$QE.FORMAT$( y0 ) { "" }
VectorCopy ( y, y0 ) { 
}


### KX ########################################################################
@qpi_K3